Впервые в Узбекистане внедрил в практику операции Фонтена, Глена и Биглена, артериальное переключение при сложных врожденных пороках сердца, внедрил в Узбекистане аорто-коронарное шунтирование на работающем сердце при ИБС (ишемическая болезнь сердца).

По приглашению Замбийского государства организовал кардиохирургический Центр в Университетском клиническом госпитале в городе Лусака. В Замбии Бабаджанов провел более 200 операций при различных патологиях сердца.

За время своей профессиональной деятельности Каландар Бабаджанов провел более 8000 операций на открытом сердце при различных патологиях: протезирование митральных и аортальных клапанов, двухклапанное протезирование, радикальные корреляции Тетрады Фалло и другие операции при сложных врожденных пороках.